第一百五十三章 Sanger基因测序法
吴哲闪过刚刚看的资料，脑中是有那么一点想法的。抬头回道：
“嗯，有点想法，可是资料和数据还是太少，我需要郑师兄帮我一起弄数据。”
唐梦精神不由一震，她是知道吴哲不是信口开河的人，连忙道：
“其实你可以直接开口的, 郑师兄人不错，对我们这些学弟学妹还是很照顾的。”
吴哲点了点头：“呃，我看出他人不错，不然也不会真想着帮他减肥。真当我没事喜欢给人画画啊！”
“那你给我说说，你有什么想法？”唐梦露出好奇的神色。吴哲这才来一个上午，就有所发现。她也想听听吴哲的想法，科研不怕错, 就怕没方向。
吴哲笑着道：“说起来容易, 可能不能实现还两说呢？我觉着有两个方面可以着手, 一是更换现在统计数据的算法，从数学方面入手，看能不能优化。第二则是考虑能不能更换以前的测序方法。”
唐梦听完也是连连点头。对着吴哲说道：“阿哲这两种方法第一种还有可能，但是第二种的话很难，现在的测序标准你应该也知道，两种方法都是二十多年前的方法。经过这么多年了，从来没有人再提出新的理论出来。”
现在的基因测序所用方法还是用的上世纪70年代年由桑格（sanger）和考尔森开创的链终止法或者是由马克西姆和吉尔伯特发明的化学法（链降解）.
sanger法的核心原理是：由于ddntp（4种带有荧光标记的a，c，g，t碱基）的2’和3’都不含羟基，其在dna的合成过程中不能形成磷酸二酯键，因此可以用来中断dna的合成反应, 在4个dna合成反应体系中分别加入一定比例带有放射性同位素标记的ddntp（分别为：ddatp，ddctp，ddgtp和ddttp）, 然后利用凝胶电泳和放射自显影后可以根据电泳带的位置确定待测分子的dna序列。
这个方法现在是主流测绘方法，后面出现的焦磷酸测序法、连接酶法等等，他们的核心手段都是利用了sanger中可中断dna合成反应的dntp。所以现在的手段基本脱不开sanger法。
所以唐梦才会说吴哲想要创造一种新的测绘方法会非常难。
吴哲笑了笑道：“我只是有这么个想法而已，先从sanger法上，看看数据计算上面能不能改进下方法吧！然后我要亲自试验下sanger法的操作，别让人觉着我进了基因所后，连个上手都不会。”
“那简单，烦就烦在基因比对和读取上，sanger法的操作，基本所里的人都会。要不我教你？”唐梦娇笑着看着吴哲，难得能碰上吴哲不会的。
“干嘛这么看着我？我又没上手过，当然不会。你还真当我什么都会啊！”吴哲看着唐梦，忍不住轻轻捏了下她的鼻子。
唐梦下午有课，待到上课前就回去上课了。吴哲则开始研究起前面的实验数据起来。然后，把两年来所有的实验数据全部装进了脑袋，脑中开始推演这些数据的共性和差异性。也顺手拿起了草稿纸开始写写画画起来。
等郑义仲回到办公室，看着已经铺了一桌子的草稿纸。开口问吴哲道：“我这刚离开几个小时，阿哲，你这是准备干什么？”
吴哲头也没抬道：“郑师兄，你中药买了？我看看能不能优化一下算法。然后看能不能重新写一个计算程序？”
郑义仲立马放下手中东西，走到吴哲身边道：“能办到吗？这要是成了，那功劳可就大了, 现在最缺的就是时间。”
然后目光看向了吴哲所写的数学算法和模型。然而，他看了寂寞。这满纸的拉丁符号，一个一个都还认识，可连在一起，那和道家的符箓差不多了。
见郑义仲一直在研究的样子，吴哲忍不住问道:“师兄，我上面哪里有问题吗？”
谷鳽
吴哲话一出口，郑义仲拿纸的手都抖了下，然后清了清嗓子道：“师弟，这你算是问对人了，这里问题大了去了。”
吴哲听到这话也是一惊，不由放下了笔，抬头看向了站在身前的郑义仲。神情也是疑惑地道：“哪里错了吗？你那才一个开头而已。照理不会出错啊！”
“嘿嘿嘿，别急嘛！我又没说你错，我想说的是你做数学算法怎么数字都没几个的，满纸都是字母？”郑义仲尴尬地问道。
吴哲松了口气，然后白了眼郑义仲。你都看不懂，你还拎着研究个半天。不再理会他，继续埋头演算。
数学好就牛啊？得，这次让一个大一的学弟给鄙视了。可这还真没办法。数学好的人牛逼起来是真牛逼，不会起来也是真不会。这数学学到后面就是符号比数字多了。
等到唐梦放学，吴哲还在建模。这可比在大学生数学建模大赛难多了。
唐梦的数学，明显是过关的。翻着吴哲的演算纸，也大致明白也吴哲的思路。按吴哲的思路进行的话，比对时间可以提高三分之一，别以为这数据不怎么样。这已经是很大的进步了。
知道吴哲的思路后，唐梦也加入了进来。两人搭档，进度就快了不少。
天也慢慢暗了下来。
郑义仲对着两人道：“回去了吗？我可先走了。”
吴哲笑着回道：“师兄先走吧，别忘了吃那中药，过几天看效果。我可还想你帮我的忙呢？”
“那没说的，只要有用。我必然会遵守诺言。”行了，我就先走了。
吴哲和唐梦也没到很晚，只要是吴哲不想唐梦饿着肚子陪她。再说演算的数据模型已经通过了他的数学演算。接着就是进行编程了。
“梦梦我们也回去吧！一时半会的肯定弄不好。”吴哲对还在那笔写算式的唐梦道。
“好呀！等我这边写完。”唐梦写好后，把自己写的那一部分递给了吴哲。
吴哲顺手拿起后，快速地看了一遍。然后赞道：“真不愧是能压住一个高中时代的人，这水平可不低啊！”
唐梦回了个你才知道的神情。
吴哲笑着把下午郑义仲看草稿纸上面算式时的事情和唐梦讲了一下。
“我还以为郑师兄是个高手，也怕自己算错了，还小心翼翼的看着他，他给我来一句：上面符号太多，数字太少。我差点没绷住。”
唐梦听到这，也是“咯咯咯”地笑了起来。
“嗯，有点想法，可是资料和数据还是太少，我需要郑师兄帮我一起弄数据。”
唐梦精神不由一震，她是知道吴哲不是信口开河的人，连忙道：
“其实你可以直接开口的, 郑师兄人不错，对我们这些学弟学妹还是很照顾的。”
吴哲点了点头：“呃，我看出他人不错，不然也不会真想着帮他减肥。真当我没事喜欢给人画画啊！”
“那你给我说说，你有什么想法？”唐梦露出好奇的神色。吴哲这才来一个上午，就有所发现。她也想听听吴哲的想法，科研不怕错, 就怕没方向。
吴哲笑着道：“说起来容易, 可能不能实现还两说呢？我觉着有两个方面可以着手, 一是更换现在统计数据的算法，从数学方面入手，看能不能优化。第二则是考虑能不能更换以前的测序方法。”
唐梦听完也是连连点头。对着吴哲说道：“阿哲这两种方法第一种还有可能，但是第二种的话很难，现在的测序标准你应该也知道，两种方法都是二十多年前的方法。经过这么多年了，从来没有人再提出新的理论出来。”
现在的基因测序所用方法还是用的上世纪70年代年由桑格（sanger）和考尔森开创的链终止法或者是由马克西姆和吉尔伯特发明的化学法（链降解）.
sanger法的核心原理是：由于ddntp（4种带有荧光标记的a，c，g，t碱基）的2’和3’都不含羟基，其在dna的合成过程中不能形成磷酸二酯键，因此可以用来中断dna的合成反应, 在4个dna合成反应体系中分别加入一定比例带有放射性同位素标记的ddntp（分别为：ddatp，ddctp，ddgtp和ddttp）, 然后利用凝胶电泳和放射自显影后可以根据电泳带的位置确定待测分子的dna序列。
这个方法现在是主流测绘方法，后面出现的焦磷酸测序法、连接酶法等等，他们的核心手段都是利用了sanger中可中断dna合成反应的dntp。所以现在的手段基本脱不开sanger法。
所以唐梦才会说吴哲想要创造一种新的测绘方法会非常难。
吴哲笑了笑道：“我只是有这么个想法而已，先从sanger法上，看看数据计算上面能不能改进下方法吧！然后我要亲自试验下sanger法的操作，别让人觉着我进了基因所后，连个上手都不会。”
“那简单，烦就烦在基因比对和读取上，sanger法的操作，基本所里的人都会。要不我教你？”唐梦娇笑着看着吴哲，难得能碰上吴哲不会的。
“干嘛这么看着我？我又没上手过，当然不会。你还真当我什么都会啊！”吴哲看着唐梦，忍不住轻轻捏了下她的鼻子。
唐梦下午有课，待到上课前就回去上课了。吴哲则开始研究起前面的实验数据起来。然后，把两年来所有的实验数据全部装进了脑袋，脑中开始推演这些数据的共性和差异性。也顺手拿起了草稿纸开始写写画画起来。
等郑义仲回到办公室，看着已经铺了一桌子的草稿纸。开口问吴哲道：“我这刚离开几个小时，阿哲，你这是准备干什么？”
吴哲头也没抬道：“郑师兄，你中药买了？我看看能不能优化一下算法。然后看能不能重新写一个计算程序？”
郑义仲立马放下手中东西，走到吴哲身边道：“能办到吗？这要是成了，那功劳可就大了, 现在最缺的就是时间。”
然后目光看向了吴哲所写的数学算法和模型。然而，他看了寂寞。这满纸的拉丁符号，一个一个都还认识，可连在一起，那和道家的符箓差不多了。
见郑义仲一直在研究的样子，吴哲忍不住问道:“师兄，我上面哪里有问题吗？”
谷鳽
吴哲话一出口，郑义仲拿纸的手都抖了下，然后清了清嗓子道：“师弟，这你算是问对人了，这里问题大了去了。”
吴哲听到这话也是一惊，不由放下了笔，抬头看向了站在身前的郑义仲。神情也是疑惑地道：“哪里错了吗？你那才一个开头而已。照理不会出错啊！”
“嘿嘿嘿，别急嘛！我又没说你错，我想说的是你做数学算法怎么数字都没几个的，满纸都是字母？”郑义仲尴尬地问道。
吴哲松了口气，然后白了眼郑义仲。你都看不懂，你还拎着研究个半天。不再理会他，继续埋头演算。
数学好就牛啊？得，这次让一个大一的学弟给鄙视了。可这还真没办法。数学好的人牛逼起来是真牛逼，不会起来也是真不会。这数学学到后面就是符号比数字多了。
等到唐梦放学，吴哲还在建模。这可比在大学生数学建模大赛难多了。
唐梦的数学，明显是过关的。翻着吴哲的演算纸，也大致明白也吴哲的思路。按吴哲的思路进行的话，比对时间可以提高三分之一，别以为这数据不怎么样。这已经是很大的进步了。
知道吴哲的思路后，唐梦也加入了进来。两人搭档，进度就快了不少。
天也慢慢暗了下来。
郑义仲对着两人道：“回去了吗？我可先走了。”
吴哲笑着回道：“师兄先走吧，别忘了吃那中药，过几天看效果。我可还想你帮我的忙呢？”
“那没说的，只要有用。我必然会遵守诺言。”行了，我就先走了。
吴哲和唐梦也没到很晚，只要是吴哲不想唐梦饿着肚子陪她。再说演算的数据模型已经通过了他的数学演算。接着就是进行编程了。
“梦梦我们也回去吧！一时半会的肯定弄不好。”吴哲对还在那笔写算式的唐梦道。
“好呀！等我这边写完。”唐梦写好后，把自己写的那一部分递给了吴哲。
吴哲顺手拿起后，快速地看了一遍。然后赞道：“真不愧是能压住一个高中时代的人，这水平可不低啊！”
唐梦回了个你才知道的神情。
吴哲笑着把下午郑义仲看草稿纸上面算式时的事情和唐梦讲了一下。
“我还以为郑师兄是个高手，也怕自己算错了，还小心翼翼的看着他，他给我来一句：上面符号太多，数字太少。我差点没绷住。”
唐梦听到这，也是“咯咯咯”地笑了起来。